在临床上十三味菥蓂丸可以与补中益气丸、六味地黄丸等药物进行配伍。但需要注意的是，在服用任何一种药物时都需要严格遵照医嘱。

1.补中益气丸：十三味菥蓂丸是一种由菥蓂子、诃子(去核)、余甘子、牛蒡子(炒)等中药材组成的中成药，具有清热解毒的功效，在临床上常用于治疗急性细菌性痢疾、慢性细菌性痢疾等疾病引起的腹痛、腹泻等症状。而补中益气丸也是一种中成药，主要成份有黄芪(蜜炙)、党参、白术(炒)、当归等，两种药物之间没有明显的冲突，同时服用后也不会影响到疾病的恢复，所以是可以同用的。

2.六味地黄丸：十三味菥蓂丸还能够和六味地黄丸联合用药，因为这两种药物都属于滋补类中药，其中六味地黄丸是由熟地黄、牡丹皮、山茱萸(制)、泽泻等多种药材组合而成，具有滋阴补肾的功效，如果患者存在腰膝酸软、骨蒸潮热、盗汗遗精等情况，可以在医生指导下联合使用上述两种药物来进行调理。

3.其他情况：如妇科千金片、血府逐瘀胶囊等，由于十三味菥蓂丸与其他多种药物不存在配伍禁忌，因此通常也可以联合应用，建议患者需要根据自身病情咨询专业医师或药师后再行用药。

若服药期间出现不适症状，应及时去医院中医内科就诊，完善望诊、问诊等相关检查明确诊断，然后积极对症治疗。