苦参凝胶是一种中成药，具有清热燥湿、杀虫止痒的作用。如果遵医嘱使用此药物，则可以起到治疗疾病的效果；但如果长期用药，则可能会出现阴道菌群紊乱、月经失调等不良反应。

1.阴道菌群紊乱：苦参凝胶的主要成分是苦参素，如果患者长时间地应用该药物进行治疗，容易导致体内的正常菌群被抑制，从而引起阴道菌群失衡的情况发生。此时不仅无法达到理想的疗效，还可能诱发一系列不适症状，比如分泌物增多、有异味等。因此，在用药期间需要严格遵循医生的建议，不可以自行盲目延长用药时间。

2.月经失调：此外，由于苦参凝胶能够起到凉血解毒的功效，如果长期服用此药物，则有可能会导致子宫受到刺激，从而引发腹痛、月经量减少等症状发生。若不及时停止用药，并且到医院就诊处理，则可能会进一步发展为闭经，严重时还会增加不孕的风险。所以，对于正处于月经期的女性而言，要禁止使用此药物。

除此之外，部分人群在使用后还可能出现头晕、恶心以及皮肤瘙痒等不良反应。另外，孕妇及哺乳期妇女应慎用此药，对该药过敏者禁用。若服药后出现其他不适，还需及时就医诊治，以免延误病情。