目前临床上没有明确说明乾元丸有副作用的文献报道。但患者在服用乾元丸期间可能会出现恶心、呕吐等胃肠道反应，以及过敏反应。

1.恶心、呕吐：乾元丸是一种中成药制剂，主要成分是由黄连(姜制)、人参、当归、熟地黄、白芍、川芎、麦冬、阿胶、党参、玄参、牡丹皮、甘草组成，具有滋阴养血的功效。如果患者长期或过量服用乾元丸，会对肠胃造成一定的刺激，导致部分人会出现腹痛、腹泻等症状。此时需要立即停药，并用清水进行局部冲洗，必要时可遵医嘱口服双歧杆菌三联活菌胶囊、乳酸菌素片等缓解症状。

2.过敏反应：由于乾元丸属于药物，进入人体后会发挥其作用。若对其中某种成分过敏的人群使用此药，则可能出现皮肤瘙痒、红疹、喉头水肿等不良反应。此时需及时停止用药，必要时可在医生指导下应用氯雷他定片、盐酸西替利嗪片等抗组胺类药物治疗。

另外，孕妇及脾胃虚寒者慎服乾元丸，以免加重病情。如与其他药物同服时，可能会发生化学反应，建议在专业医师指导下配伍用药。此外，在用药期间还需要注意饮食清淡，避免吃辛辣刺激性食物，比如辣椒、生姜、大蒜等，以免影响疾病恢复。