如果遵医嘱按疗程、剂量服用蒿甲醚胶丸，并不会对身体造成什么伤害。但如果长期过量地吃蒿甲醚胶丸，则可能会出现胃肠道反应、肝肾功能损伤等不良影响。

1.胃肠道反应：由于蒿甲醚胶丸是一种抗疟药，其主要成份为蒿甲醚，在临床上主要用于治疗疟疾。若患者在医生的指导下合理用药一般不会有明显的副作用。但部分人群可能因体质敏感而引起恶心呕吐、腹痛腹泻等不适症状，此时应立即停药并及时就医进行处理。

2.肝肾功能损伤：蒿甲醚需要通过肝脏和肾脏代谢出体外，若长时间大量服药则会增加肝肾负担，严重时可导致肝肾功能异常，表现为黄疸、尿色加深等症状。因此建议定期监测肝肾功能，若有明显异常需及时就诊处理。

3.过敏反应：对于蒿甲醚或制剂中任何辅料有过敏史者禁用此药物，否则有可能会出现皮肤瘙痒、红疹、呼吸困难甚至休克等过敏反应，严重情况下还会危及生命安全。

4.其他：部分患者还可能出现头晕头痛、失眠多梦、胸闷气短以及视力模糊等情况，通常停止用药后上述症状即可消失。

另外，孕妇及哺乳期妇女应在医师指导下使用该药，儿童必须在成人监护下使用。若正在服用其他药品，应用本品前请咨询医师或药师。