若患者存在慢性萎缩性胃炎、胃溃疡等疾病，在医生指导下服用复方胃蛋白酶颗粒的同时，还可以遵医嘱与其他多种药物联合应用。但若是治疗其他疾病，则需要根据具体病情在专业医师的指导下来选择用药。

1.西沙必利：复方胃蛋白酶颗粒是一种中成药制剂，主要成份包括党参、陈皮、山楂以及胃蛋白酶等，具有健脾和胃的功效，常用于治疗肝郁气滞所引起的反酸、嗳气、纳差等症状。而西沙必利属于一种消化道动力药，常用剂型为片剂、胶囊剂等，适用于缓解由胃肠道功能紊乱所引起的恶心、呕吐、上腹胀满及上腹疼痛等不适症状。两种药物之间不存在配伍禁忌，因此可以在医生的指导下联合用药，有助于促进疾病的恢复。

2.奥美拉唑肠溶胶囊：如果患有十二指肠溃疡或胃溃疡等疾病时，通常会出现腹部饱胀感、烧灼样痛的症状，并且还会伴有食欲减退的情况发生。此时则可在医生的指导下配合使用复方胃蛋白酶颗粒进行治疗，能够起到一定的改善作用。但由于该药物中含有氢氧化铝等抗酸药物，容易影响机体对钙离子和其他重要微量元素的吸收，所以不建议长期大量服用。必要时可遵医嘱同时搭配使用奥美拉唑肠溶胶囊等抑酸药物共同治疗。

3.克拉霉素缓释片：由于胃黏膜组织受到幽门螺杆菌感染后，可能会引起胃部炎症反应，从而出现腹胀、钝痛、烧心以及反酸等情况。此时还可遵医嘱联合使用复方胃蛋白酶颗粒和克拉霉素缓释片等药物进行治疗，因为其中前者属于中成药，后者属于抗生素类药物，两者联用不仅不会产生毒副作用，而且还能够使药物疗效达到协同作用，更有利于身体的恢复。

4.硫糖铝混悬凝胶：对于患有浅表性胃炎或者糜烂性胃炎等疾病的患者来说，单纯通过服用复方胃蛋白酶颗粒可能无法达到治愈的目的。此时还应遵照医嘱同时搭配使用硫糖铝混悬凝胶等保护胃黏膜的药物来治疗，以防止疾病进一步加重。

此外，从中医角度分析，部分患者认为复方胃蛋白酶颗粒可以与阿莫西林胶囊、双歧杆菌三联活菌散等药物同服，但是并没有科学依据。因此当患者出现上述适应证时，需及时到医院就诊检查，明确病因后再针对性用药治疗。