在遵照医生指导的前提下，偶尔、少量地应用帕朱丸一般不会对身体造成伤害。但如果长期大量服用，则可能会出现一定的副作用，如损伤脾胃阳气、加重体内的热证等。

1.损伤脾胃阳气：由于帕朱丸属于苦寒之品，如果患者长时间或大量吃该药物，容易伤及脾胃的阳气，导致胃阴受损而形成胃不和症候群，表现为纳呆、腹胀、嗳气、反酸、口淡无味等症状。此时可以在医生指导下加用香砂养胃丸、附子理中丸等温中健脾的药物进行治疗。

2.加重体内热证：由于帕朱丸具有清热的作用，若长期大量用药则会耗损人体津液，使内生的虚火得不到及时有效的清除，从而进一步化燥伤津，加重原有的实热或者出现新的上火症状，比如鼻腔干燥、咽干口燥、五心烦热、潮热盗汗、舌红少苔、脉细数等。建议此类人群在医生辨证后，根据自身病情选择合适的剂量，并且要严格遵循医嘱来调整药量，不可自行盲目增减药量以及延长服药时间。

此外，孕妇应慎用此药，以免引起流产的情况发生；而对于患有高血压、心脏病、肝病、肾病等慢性疾病的患者，在服药前也需咨询专业医师。