化毒丸会引起恶心、呕吐等胃肠道不适症状，也可能引发皮疹、瘙痒等过敏反应，严重时会导致肝功能异常。
化毒丸中含有马兜铃酸等具有肝毒性作用的物质，长期服用可造成肝细胞损伤。该药物还含有朱砂，其含有的硫化汞对人体有毒性，过量摄入会损害神经系统和肾脏。因此，在用药期间需要密切观察身体变化，如发现异常应及时停药并向医生咨询。
在极少数情况下，化毒丸还可能导致头痛、心悸或呼吸困难等症状发生。
使用化毒丸时需注意个体差异及可能出现的不良反应，并遵医嘱调整剂量或更换治疗方案。患者应定期监测肝肾功能，避免长期大量使用以减少潜在风险。
