久痢丸对因湿热所致的久痢有较好疗效，但对其他病因引起者效果有限。
久痢丸中含有的黄连、黄柏等药材能清除湿热邪气，故适用于湿热型久痢。而久痢还可能是脾胃虚弱、肾阳虚衰等症候导致的，此时服用久痢丸并不能起到良好的治疗效果。在使用久痢丸时，应先明确久痢的具体病因，以免延误病情。
久痢丸对于脾胃虚弱引起的久痢不愈可能没有明显的改善作用。因为久痢丸中的黄连、黄芩等中药具有清热燥湿的作用，主要用于治疗由湿热蕴结肠腑所引起的久痢。
久痢患者需注意饮食调理，避免食用生冷、油腻、辛辣刺激性食物，以减少肠道负担，有利于恢复。同时可适当增加膳食纤维摄入量，促进肠道蠕动，但不可过量，以免加重症状。
