长期服用清肝利胆胶囊可能会产生一定的副作用，如损伤肝脏功能、影响消化系统等。因此，在使用药物时需要遵循医生的建议，并严格按照药品说明书上的用药指导进行。

1.损伤肝脏功能：清肝利胆胶囊的主要成分为柴胡、泽泻、黄芩、栀子、木通和车前草等中药成分，这些药材均有一定的药理作用，具有解毒、消炎、利湿、退黄等功效。但是长期或过量服用可能导致肝脏负担增加，甚至引起肝细胞损害，从而导致转氨酶升高、黄疸等症状出现。对于有慢性肝病史或其他肝功能异常的人群来说，更应该谨慎使用此药。

2.影响消化系统：清肝利胆胶囊中的某些成分也可能对胃肠道造成刺激，引发恶心、呕吐、腹泻等不适症状。特别是对于患有胃肠疾病的人来说，更容易出现这些问题。此外，长期服用还可能破坏正常的胃肠道菌群平衡，进一步加重病情。

3.其他不良反应：部分患者在长期服用清肝利胆胶囊后可能出现头晕、头痛、乏力等神经系统症状，以及过敏性皮疹、瘙痒等皮肤反应。如果出现以上情况，应立即停药并就医。

综上所述，虽然清肝利胆胶囊具有一定的疗效，但其副作用也不容忽视。在选择使用该药物之前，请务必咨询专业医师的意见，并按照医嘱规定的剂量和疗程进行用药。如有任何不适症状，应及时告知医生并停止用药。