本品用于治疗 :新诊断的多形性胶质母细胞瘤，开始先与放疗联合治疗，随后作为辅助治疗 ；常规治疗后复发或进展的多形性胶质母细胞瘤或间变性星形细胞瘤。

主要用于治疗小细胞肺癌，恶性淋巴瘤，恶性生殖细胞瘤，白血病，对神经母细胞瘤，横纹肌肉瘤，卵巢癌，非小细胞肺癌，胃癌和食管癌等有一定疗效。

环磷酰胺是广泛应用的抗癌药物之一，治疗恶性淋巴瘤、多发性骨髓瘤、乳腺癌、小细胞肺癌、卵巢癌、神经母细胞瘤、视网膜母细胞瘤、尤文瘤、软组织肉瘤以及急性白血病和慢性淋巴细胞白血病等都有明显疗效。目前环磷酰胺多与其他抗癌药级成联合化疗用于临床治疗。本药也作为免疫抑制剂治疗非肿瘤疾患。

适用于视网膜中央静脉阻塞，眼前房出血，青光眼，脑血管病后遗症的治疗，也可用于治疗病毒性肝炎。