止咳胶囊可能会引发中枢抑制、胃肠道刺激及过敏反应等不良反应。
止咳胶囊中含有的麻黄碱、愈创甘油醚等成分具有中枢抑制作用，可引起嗜睡、头晕等不适症状；而其马兜铃酸等成分则会对胃黏膜产生刺激，可能导致恶心呕吐等胃肠道反应。此外，个别人群可能对其中的某些成分产生过敏反应，表现为皮疹、瘙痒等症状。因此，在使用止咳胶囊时应注意观察是否出现上述不良反应，并在必要时及时停用并向医生咨询。
如果患者存在肝功能不全或药物代谢障碍等情况，这些患者的药物半衰期会延长，导致毒性积累，从而增加中枢抑制的风险。
止咳胶囊需按医嘱服用，不宜长期大量使用，以免因滥用导致耐药性增强或成瘾。同时，若发现有异常情况发生应及时就医处理。
