头孢噻啶和头孢他啶都属于第三代头孢菌素，可以用于治疗葡萄球菌、大肠杆菌、克雷伯杆菌、绿脓杆菌等引起的感染。两者的区别主要在于药物成分不同、药理作用不同、不良反应不同、抗菌作用不同等方面。

1、药物成分不同：头孢噻啶的主要成分是头孢噻吩钠，头孢他啶的主要成分是头孢他啶，两者药物成分不同;

2、药理作用不同：头孢噻啶具有广谱抗菌作用，可以通过抑制细菌细胞壁的合成，从而引起细胞的破坏，导致细菌死亡。头孢他啶具有抗菌谱广、杀菌力强等特点，可与敏感的抗生素联合使用，增加对某些细菌的疗效;

3、不良反应不同：头孢噻啶在服用后可能会引起恶心、呕吐、腹泻等胃肠道反应，也可能会出现皮疹、瘙痒等过敏反应。头孢他啶安全性较高，不良反应较少，常见的是过敏反应，如皮疹、荨麻疹等;

4、抗菌作用不同：两者药物都具有一定的抗菌作用，但头孢噻啶对于金黄色葡萄球菌、肺炎球菌、溶血性链球菌等有较好的治疗效果。头孢他啶对于大肠埃希菌、奇异变形杆菌、克雷伯杆菌等病菌有较好的治疗作用。

以上两种药物均可用于治疗细菌感染引起的疾病，但由于两者均为抗生素药物，因此患者在用药前应前往医院明确诊断，在专业医生指导下根据患者自身病情选择合适的药物进行治疗。