它是一种强氧化剂，可以杀灭细菌，为家庭必备的常用消毒药。在妇科方面，0.01％的高锰酸钾水溶液可以用于阴道冲洗；0.02％的水溶液用于坐浴，治疗白带过多；蜜月之中，用0.05％的水溶液清洗外阴，可预防泌尿系统感染。女性痔疮的发生率较高，用0.1％的水溶液坐盆浸泡，可止痒止痛、防止感染，促进脱出的痔核复位。

主要针对于男女生殖泌尿系感染，如支原体、衣原体、淋菌性、非淋菌性、滴虫性、细菌性、霉菌性、念球菌等引起的各种泌尿生殖感染；尿道炎、急慢性前列腺炎、睾丸炎、包皮炎、龟头炎、膀胱炎、疱疹、湿疣、肾盂肾炎；对阴道炎、盆腔炎、宫颈炎（糜烂）、子宫内膜炎、附件炎、手术后尿路感染等妇科病都有一定疗效。

用于化脓性、老年性阴道炎及手术前、后消毒和防止感染。