主要用于革兰阳性菌所致的皮肤软组织感染、呼吸道感染、链球菌咽峡炎、猩红热、白喉、军团菌病、百日咳等，以及淋病、非淋病性尿道炎、痤疮等。

本品适用于链球菌、肺炎球菌和金黄色葡萄球菌等敏感菌所引起的严重感染性疾病的治疗，也可用于青霉素过敏的或临床医师判定认为青霉素类药物不适用的感染性疾病的治疗。本品可能导致抗生素所致的伪膜性肠炎的危险，医师在选择本药时应当考虑感染的情况和是否有较低毒性药物适用的可能（如红霉素）。林可霉素不宜用于轻微的细菌感染，也不宜用于病毒感染。