口腔溃疡不宜用抗生素治疗，因口腔黏膜的上皮细胞具有正常的防御功能，对病原体具有一定的抵抗能力，而抗生素多是通过杀灭病原体而达到治疗疾病的作用，对口腔溃疡的治疗有一定的不良影响，还可能会加重溃疡的症状，抗生素常见的有头孢类、大环内酯类、喹诺酮类、硝基咪唑类。
1、头孢类：常见的头孢类抗生素有头孢克肟、头孢哌酮钠、头孢克洛等，头孢类抗生素的抗菌谱比较广，通过杀灭口腔内细菌的方式治疗口腔溃疡效果较好，但不适合长期使用，且大量使用可能会出现耐药性;
2、大环内酯类：常见的大环内酯类抗生素有阿奇霉素、罗红霉素、克拉霉素等，大环内酯类抗生素的抗菌谱比较广，对革兰氏阳性菌及支原体、衣原体有较强的抗菌作用，因此口腔溃疡可以适当使用大环内酯类抗生素进行治疗;
3、喹诺酮类：喹诺酮类抗生素是临床常用的人工合成抗生素，其主要作用是阻止细菌DNA的修复、转录以及复制，从而起到抗菌作用。临床常见的喹诺酮类抗生素有氧氟沙星、左氧氟沙星、环丙沙星等，常用于针对革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌引起的各种炎症性疾病的治疗，对口腔溃疡的治疗效果也比较好;
4、硝基咪唑类：硝基咪唑类抗生素有甲硝唑、替硝唑、奥硝唑等，硝基咪唑类抗生素对厌氧菌及原虫有独特的杀灭作用。临床上常用于治疗厌氧菌引起的口腔溃疡，且副作用较大，容易引起耐药性。
此外，如患者有肝肾功能不全，不建议使用抗生素类药物，因为抗生素在体内需要经过肝肾代谢，会增加肝肾疾病的发生风险，还有可能会加重口腔溃疡的症状。
